Shuumatsu Nani Shitemasu ka? Isogashii desu ka? Sukutte Moratte Ii desu ka?

Longtemps après que des bêtes mystérieuses aient causé l'extinction de l'humanité, Willem se réveille comme le dernier homme. Une nouvelle civilisation composée de différentes races s'est développée sur des îles flottantes, mais Willem, étant humain, n'a pas sa place parmi eux. Après avoir erré sans but, il accepte à contrecoeur un emploi militaire, découvrant alors que les « armes » qu'il est chargé de garder sont en réalité des fées jeunes et innocentes. Alors qu'il apprend davantage sur ces enfants et leur lien avec son passé, le conflit avec les bêtes devient de plus en plus critique. Lorsque les filles s'apprêtent à affronter un combat qui semble voué à l'échec, Willem doit décider s'il peut réellement les aider.