Ep. 3: Motoko torna dall'estero per scoprire che il suo comandante è stato assassinato, mentre Aramaki è l'unico interessato al caso.
In onda il 19 aprile 2015

Motoko torna da una missione all'estero e scopre che il suo comandante è stato ucciso. Nota che nessuno, tranne Aramaki, sembra interessato ad agire.
Episodi
- Ep. 1 · Motoko Kusanagi coglie l'occasione durante la presa in ostaggio di una protesta pacifica da parte di terroristi
- Ep. 2 · Una malattia rara pone due cittadini al centro di una lotta per il potere militare ed economico.
- Ep. 3 · Motoko torna dall'estero per scoprire che il suo comandante è stato assassinato, mentre Aramaki è l'unico interessato al caso.
- Ep. 4 · L'indagine di Motoko sulla morte del suo comandante diventa sempre più confusa
- Ep. 5 · Eroe di guerra condannato e la sua unità prendono la città in ostaggio per l'accesso al database Pandora
- Ep. 6 · La gara contro il tempo per impedire l'apertura della scatola di Pandora continua in questa seconda parte.
- Ep. 7 · Motoko gode di un raro momento di relax e di una pausa di cinque ore prima dello scoppio delle esplosioni