Bubblegum Crisis TOKYO 2040

謎の地震によって東京は壊滅し、人工的な有機生命体であるブーマーを供給し、復興と労働に従事させるという形で、Genomが台頭する。一部のブーマーがたびたび異常動作を起こすが、専門のADポリスですらそれらを完全に制御することはできない。求職を目的として東京にやってきた山崎リナは、暴走したブーマーを装甲スーツで駆除する独立系のグループ「ナイトサバーグループ」に加わることを目指す。