Time Kyoshitsu: Tondera House no Daibouken

少年のジュスティン・ケースイは、隠しんぼのゲームで友人のアンジェラとコーキー・ロバーツを探していると、突然の嵐によって気づかぬうちに森の中にあった一軒の家に避難せざるを得なくなります。その家の中には「ソーラー・イオン・ロボット（SIR）」というロボットがおり、家を所有するハミルカイ・バムブー教授に出会います。教授は彼らにタイムマシンを見せてくれますが、嵐の最中にそのマシンを飛行させるために風船を使おうとしたところ、SIRの性格が一時的に変化し、その家がタイムトラベルを開始してしまいます。タイムトラベルの過程に誤りがあったため、子どもたちはいつ家に帰れるかまったく把握していません。旅の途中で彼らは新約聖書に記された出来事、ヨハネの洗礼者誕生から使徒パウロの登場に至るまで、さまざまな出来事に目撃し、わずかな影響しか与えない範囲で関与していきます。