Minamission!

3人の高校生——軍事学校に通う南真澄・変化流歌・富摩朱雀——は、南部の海に浮かぶ孤立した島・ノナミミへと赴き、サバイバル訓練を受けることになります。それぞれの少女には特徴的な性格があり、南真澄はボーイッシュで、変化流歌はのんびりしており、富摩朱雀は信頼できる性格を持っています。訓練の最初の日から、彼女たちは熱帯の環境に直面し、数々の困難に見舞われます。物語は、彼女たちが訓練を成功裏に終えるために、いかにしてその試練に立ち向かっていくのかを描いていきます。