Shinigami to Chocolate Parfait

高校生のジンナ・アマクラは、少々ケチな性格が知られているが、ある不思議な出来事を経験する。本来死ぬはずだったのに死ななかったため、「ソウル・イレギュラー」として分類されることになった。彼の魂を回収し、生死のバランスを回復させるために、新任の死神ナギが任命される。彼女がこの任務に失敗すれば、重大な懲罰を受けることになる。それは、彼女が大好物のデザートに変身させられ、上司に食べられてしまうことである。ナギの任務は、当初から困難で複雑なものとなる。それは、彼女とジンナの間に予期せぬ絆が生まれたためであり、この関係が上司に発覚すれば、重大な結果を招くことになるだろう。