Tonelico no Ou

少年のシロは、巨大な木の中に目を覚まし、核兵器や気候変動、エネルギー不足といった問題が存在しない未来の世界にいることを知る。この社会は「ワールド・ツリー」によって統治されており、青い髪の少女がシロに彼がかつての世界からの生存者であることを伝える。当初は混乱する彼だが、徐々にこの新しい社会を学んでいく。ここではアンドロイドが人間を補助し、基本的な論理的思考は一般的ではない。時間が経ち、生活が落ち着きルーティン化していく中で、シロの過去の記憶は次第に消えていく。物語は、理想と現実、そして個人の存在意義といったテーマを描いていく。