Fuuma no Kojirou: Yasha-hen

하쿠오 아카데미는 무술로 유명한 고등학교였지만, 라이벌인 세이식칸이 부정한 방법으로 최고의 학생들을 빼돌리면서 위기를 맞이한다. 이에 아카데미 이사장인 후쿠조 히코코는 특이한 능력을 가진 닌자 부족이 사는 품마 마을에 메시지를 보낸다. 품마 촌의 지도자는 아카데미에 코지로를 보내주기로 한다. 코지로가 도착하자마자, 세이식칸을 지원하는 야샤 클랜과 그들의 강력한 리더인 아스카 무사시와 맞서 싸우게 된다. 무사시는 희귀한 질병으로 고통받는 여동생을 돕기 위해 싸우고 있다.