Natsume Yuujinchou: Ishi Okoshi to Ayashiki Raihousha

나츠메라는 소년이 숲속에서 작은 요정 미쓰미를 만나게 되는데, 미쓰미는 오래된 요정 이와테츠를 깨우는 임무를 맡고 있다. 미쓰미의 안위를 걱정한 나츠메는 이 일을 돕기로 결심한다. 한편, 미스터리한 인물이 타누마를 정기적으로 방문하면서 짧은 대화를 나누고 떠나는데, 이 인물은 요정임이 밝혀졌지만 적대적인 모습은 보이지 않는다. 그러나 방문이 계속되면서 타누마의 건강은 점점 악화되고 있다.