Daitoshokan no Hitsujikai

Shiomi라는 대학은 규모가 매우 크고 존경받는 학교로, 일본 국립도서관에 견줄 만한 방대한 규모의 대학도서관을 보유하고 있다. 도서 동아리에 소속된 쿠로타로 쿠케이는 혼자 책을 읽기 위해 도서관을 방문한다. 어느 날, 사람들의 소원을 들어주는 존재인 '목자'의 개입을 통해, 2학년생 시라사키 쿠구미를 만난다. 시간이 지남에 따라 '목자'는 동아리에 여학생들을 추가로 모집하게 된다.