Scramble Wizards

정부 소속의 마법사 시바 주로우는 특정 조건 하에 마법사 훈련 아카데미에 강사로 파견되며, 동료 직원들과 함께 아카데미에 도착한다. 거기서는 학생인 히나사키 쿠키코를 만나는데, 그녀를 다스리는 것이 결코 쉽지 않다. 이 시기에 마법사 반대 테러 조직이 아카데미를 공격하고, 주로우는 자신이 학생들을 보호할 능력이 있는지 판단해야 한다.