Guilty Gear Xtra

Hikâye, ilk iki oyun arasındaki zaman diliminde geçiyor ve orijinal iki karakter olan Tyr ile Mizuha'nın gökyüzünden düşen Gear parçalarının gizemini araştırması etrafında dönen bir hikâyedir. Karşıt rollerde, oyun serisinde önemli bir rol oynayan gizli bir grup olan Savaş Sonrası İdare Bürosu üyelerinin hikâyeye dahil olduğu görülür. Sol, Ky, Axl, Potemkin ve Kliff dahil olmak üzere birkaç oyun karakteri de hikâyede yer alır, ancak ikincil rollerde kalmaktadırlar.