VITA Sexualis

Trong lúc giao một thiết bị mật mang tên hệ thống VITA cho đồng nghiệp của mình, Shirou gặp gỡ Amane Mao, một cô gái sở hữu sức mạnh phi thường. Hệ thống VITA là một vũ khí được thiết kế để chống lại các ERROR – những sinh vật biến dị công nghệ khổng lồ đã phá hủy Tokyo cũ cách đây mười bốn năm bằng vũ khí hủy diệt hàng loạt. Một ERROR đột ngột xuất hiện và tấn công, và sau khi nỗ lực thuyết phục đồng nghiệp của mình chấp thuận việc sử dụng VITA để bảo vệ dân thường thất bại, cô ấy đã bị giết. Không còn lựa chọn nào khác, Shirou đồng ý với yêu cầu của Mao kích hoạt VITA và tiêu diệt ERROR. Hành trình của anh với vai trò là phi công nam duy nhất của hệ thống VITA tại Trường nữ sinh St. Liddel chính thức bắt đầu.