Macross Δ

هشت سال پس از رویدادهای Macross F، پدیده‌ای مرموز به نام Var Syndrome به‌تدریج در کهکشان گسترش می‌یابد. گروه جدیدی از خلبانان ماهر Valkyrie باید در برابر این تهدید رو به رشد بایستند. علاوه بر این چالش، گروه Aerial Knights، تیمی از خلبانان Valkyrie متعلق به پادشاهی Wind، برای رقابت با Delta Squadron حضور می‌یابند.