Yu☆Gi☆Oh!: Chou Yuugou! Toki wo Koeta Kizuna

Habang nasa Turbo Duel kasama sina Jack Atlas at Crow Hogan, ang Stardust Dragon ni Yusei Fudo ay inagaw ni Paradox, isang Turbo Duelist mula sa hinaharap, at ginawang Sin Monster. Hinabol ni Yusei si Paradox sa pamamagitan ng time slip sa tulong ng Crimson Dragon at narating ang nakaraan. Doon, hinarap ni Paradox si Jaden Yuki, na may kapangyarihan pa rin ni Yubel at ng The Supreme King, ngunit nabihag ang karagdagang mga dragon at natalo si Jaden, na nang lumaon ay iniligtas ni Yusei. Inihayag ni Jaden ang balak ni Paradox na lipulin si Maximillion Pegasus, ang lumikha ng Duel Monsters, sa pamamagitan ng pagnanakaw at paninira sa makapangyarihang mga halimaw sa iba't ibang panahon. Naglakbay sina Yusei at Jaden nang mas malayo sa nakaraan upang harapin si Paradox, na nakatagpo si Yugi Mutou. Pagdating ng panahong iyon, inatake na ni Paradox ang panahon ni Yugi, na tila pumatay kay Pegasus at sa lolo ni Yugi, at inagaw ang Blue-Eyes White Dragon at Red-Eyes Black Dragon. Matapos malaman ang buong kuwento, sumama si Yugi kina Yusei at Jaden sa isang huling tatlong-laban-sa-isang duel upang palayain ang mga nabihag na halimaw at maiwasan ang pagkawasak ng panahon.