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Un jeune homme nommé Kamui Shirou tient le destin de l'univers entre ses mains, car il doit choisir entre détruire les Dragons de la Terre ou les Dragons du Ciel. Deux forces opposées sont en guerre, et sa décision déterminera si l'humanité est éradiquée pour un univers purifié ou protégée afin de préserver la civilisation. Hinoto et Kanoe, deux oracles et sœurs, prévoient le conflit et soutiennent des issues opposées. Chacune accumule des forces pour assurer la réalisation de sa vision, sans savoir que Kamui possède un pouvoir supérieur à celui des dragons eux-mêmes. Ses actes décideront finalement de l'avenir du monde, même si l'étendue exacte de son rôle dans la lutte des sœurs reste encore incertaine.