Hana to Kurage to Refrain

एक हाई स्कूल की प्रथम वर्ष की छात्रा और ओकल्ट रिसर्च क्लब की सदस्य अपने क्लब के साथियों के साथ स्थानीय श्राइन का दौरा करती है ताकि अलौकिक अफवाहों की जांच की जा सके। वहाँ, वह एक कक्षा साथी से मिलती है जो गायब होने के रहस्यमयी मामलों पर शोध कर रहा है। वह श्राइन ही वह स्थान है जहाँ दस साल पहले वह कुछ समय के लिए गायब हो गई थी। उसके रुचि को देखकर वह इस रहस्य को सुलझाने में शामिल हो जाती है, जिससे अजीबोगरीब घटनाएँ घटित होने लगती हैं। कहानी में अलौकिक तत्वों को रोमांटिक कॉमेडी के साथ मिलाया गया है, जैसे-जैसे जांच के दौरान उनका रिश्ता विकसित होता है।