Muv-Luv Alternative: Tsukikage wa Yamiyo ni Arite

कहानी मुख्य रूप से Tsukuyomi Mana के पृष्ठभूमि और प्रारंभिक जीवन पर केंद्रित है, जिसमें Maya को भी कुछ महत्व दिया गया है। यह Meiya और Yuuhi के साथ उनके सामने आने और बातचीत को दर्शाती है, साथ ही Alternative से जुड़ी विभिन्न घटनाओं पर उनके दृष्टिकोण को भी प्रस्तुत करती है।