Muv-Luv Alternative: Tsukikage wa Yamiyo ni Arite

История сосредоточена на происхождении и раннем детстве Tsukuyomi Mana, с некоторым вниманием к Maya. В ней изображены их встречи и взаимодействие с Meiya и Yuuhi, а также их взгляды на различные события из Alternative.