Ep. 96: La squadra di scienziati ninja si infiltra nella base sommersa di Galactor nascosta in una grotta.

Le informazioni dell'ISO individuano il quartier generale di Galactor vicino alla gola del fiume Lelo, costringendo la squadra a viaggiare in canoa mentre Ryu rimane indietro con il Dio Fenice. Dopo che un uomo sconosciuto interferisce con il loro viaggio, viene catturato da Galactor, che lo usa per attirare la squadra di ninja nella loro base sotterranea. Jinpei sfugge per un soffio a una trappola del soffitto che si chiude, ma Ken e gli altri vengono catturati. Ryu vola segretamente con il Dio Fenice verso il sito nonostante l'esitazione iniziale. L'uomo catturato, rivelando che il suo salice è stato distrutto in una battaglia precedente, aiuta la squadra aprendo il soffitto. Jinpei lancia una bomba per liberare i suoi compagni e fuggono con l'uomo. Ken poi distrugge la base con un missile, mentre l'uomo salvato riflette sui pesanti oneri del suo ruolo nel conflitto.
Episodi
- Ep. 92 · La Base Crescent affonda mentre la squadra distrugge il loro ex quartier generale per impedire a Galactor di recuperare i dati.
- Ep. 93 · Katse lancia siluri sotterranei mentre la Science Ninja Team si infiltra nella base per recuperare dati cruciali.
- Ep. 94 · La bestia demoniaca elettrica Angler attacca la centrale elettrica di Torasshuu
- Ep. 95 · Jinpei indaga le antiche rovine ninja nelle montagne di Giove mentre cerca le sue vere origini.
- Ep. 96 · La squadra di scienziati ninja si infiltra nella base sommersa di Galactor nascosta in una grotta.
- Ep. 97 · Leona 3: il team ninja della scienza indaga su sabotaggio e personale scomparso mentre la navicella rischia un impatto imminente.
- Ep. 98 · Joe incontra una donna misteriosa e affronta una nuova minaccia mecha mentre nasconde la sua condizione.
- Ep. 99 · La squadra di ninja della scienza si infiltra in una base mentre Joe lotta con la vista compromessa e i dubbi su se stesso.
- Ep. 100 · Lo scienziato ninja insegue Katse fino a una base dove X ordina la sua eliminazione