Ep. 12: Madoka e Lan si separano dopo aver risolto la crisi del campo energetico e salvato Villagulio.

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Due settimane dopo, la città scopre le civiltà aliene e lo status di Lan come principessa dei Le Garite. Prima di tornare a casa, Madoka e Lan visitano la Collina dei Voti per appendere un lucchetto sotto una statua della dea, promettendo di riunirsi a Kamogawa con Muginami. I flashback rivelano che dopo la fioritura dei fiori di Lagrange è apparso un campo energetico. Madoka, guidata da Yurikano, ha ripreso il controllo di Midori per trasformare il campo con l'aiuto di Lan e Muginami. Dopo aver appreso che Youko è viva, Midori si è spento e Villagulio ha preso di mira Madoka. L'esercito dei Le Garite, guidato da Dizelmine, è intervenuto, permettendo a Muginami di partire con Villagulio per salvarlo. Nel presente, Madoka e Lan si salutano. Moid viene rivelato come osservatore di Dizelmine. Mentre l'autunno si avvicina, Asteria mostra la sua memoria a Youko e Madoka riceve una lettera da Muginami.