Ep. 49: Shun e Yuya concludono i loro duelli mentre Reiji rivela che il Battle Royale era un esame di selezione per i Lancer.

Shun continua a combattere contro la Obelisk Force nonostante le ferite, ricevendo un aiuto inaspettato da Shingo e Noboru. Contemporaneamente, Yuya affronta Sora, che inizialmente lo deride, ma Yuya riesce a trasmettere i suoi sentimenti, spingendo Sora a ripensarci. La partita termina a mezzogiorno, concludendo il Battle Royale. Yuya chiede a Sora dell'identità vera di Yuzu, inducendo Sora ad attivare la funzione di ritorno forzato del suo Duel Disk per fuggire verso la Dimensione Fusione. Reiji appare su una passerella superiore, avendo osservato tutti i duelli. Shingo conferma di aver eliminato i partecipanti della Duel Academy come richiesto, notando che il Battle Royale ha svolto la funzione di esame di selezione per i Lancer. Si dichiara un Lancer, confondendo Noboru e scioccando Yuya, che fissa impassibile Reiji.

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