AKB0048 Heart-Gata Operation

4人の人物が、著名な宇宙泥棒エリクサーからオリジナルのAKBの伝説的な衣装を守るためのミッションに選ばれる。その中には最後のAKB0048のトレーニーである篠野メカナと、13代目前田亜美子、9代目大島祐香、8代目小嶋ハルナの3人のメンバーが含まれる。この目的を達成するため、彼らは衣装が保管されている学園に入学する。この挑戦を遂行する中で、彼らは銀河最大の天才泥棒と対峙しなければならない。物語には追加の章が含まれている。