AKB0048 Heart-Gata Operation

4명의 인물이, 유명한 갤럭시 강도 엘릭서(Elixir)로부터 원래의 AKB의 전설적인 의상을 보호하기 위한 임무를 맡는다. 이들은 마지막 남은 AKB0048 트레이너 신오노메 카나타와 13대 메이다 아츠코, 9대 오시마 유코, 8대 코지마 하루나라는 3명의 멤버로 구성된다. 이를 위해 의상이 보관되어 있는 아카데미에 입학한다. 이들이 이 도전을 감수하면서 갤럭시 최고의 전문 도둑을 맞서 싸워야 한다. 스토리는 추가 챕터를 포함한다.