Pocket Monsters: Mewtwo no Gyakushuu Evolution

科学者たちは神話のポケモンの化石を発見し、それをもとに破壊を目的とした強大な伝説のポケモン・ミュウツーを創造する。ミュウツーが自己意識を獲得すると、その創造者たちに対して敵意を抱くようになり、報復のための行動を開始する。その出来事により、アッシュ、ピカチュウ、そして仲間たちは紛争に巻き込まれることになる。ミュウツーの行動はポケモン世界の安定を脅かしており、一行はミュウツーと対峙し、さらなる破壊を防ぐ必要がある。一方ミュウツー自身も、もともとの設計を超えた新たな目的を見出す試みを迫られている。