Full Metal Panic! Invisible Victory

9개월 전, 소년 군인은 칸าม에 치도리라는 소녀를 비밀리에 지키기 시작했다. 이 기간 동안 군사 조직은 적대 세력의 위협을 효과적으로 무마했지만, 이 성공은 오히려 반대 세력의 의지를 더욱 강화시켰다. 레오나르도 테스타로사라는 남자가 칸าม에와 또 다른 인물을 방문하면서, 글로벌 통신 장애를 포함한 보다 적극적인 행동이 시작된다. 그녀의 독특한 신분 탓에 칸าม에는 반대 세력의 주요 표적이 되어, 고등학교에서 평범한 학생 생활을 이어가기는 불가능해졌다.