45화: 키라와 무가 라우를 마주치고, 디어카와 야즈크가 자신들의 사명을 되묻는 가운데 세력들이 충돌하다
2003년 8월 16일 방영
키라와 무가 라우를 만나면서 양측 모두에게 끔찍한 진실이 드러난다. 동시에 디어카와 야즈크는 별도의 회의를 통해 자신들이 맞서 싸우는 진정한 적과 갈등의 실체가 무엇인지 의문을 품기 시작한다. 이러한 개인적인 고뇌 속에서도 Dominion과 Earth Alliance는 또 다른 합동 공격을 감행한다. 대치 이후 라우는 자신의 배로 돌아와 Flay를 Earth Forces로 돌려보내며, 양측의 역학 관계가 변화한다.
에피소드 수
- 41화 · 카가리는 신비한 사진으로 키라를 대면하고, 라쿠스는 아버지의 암살 이후 반선전을 방송한다.
- 42화 · 라쿠스와 앤드류 발트펠트가 아스란을 구하고 세 척 동맹을 결성하다
- 43화 · 멘델 식민지에서의 쓰리십스 얼라이언스 은신, ZAFT와 지구 연방군 추격
- 44화 · 무와 디어카가 라우를 마주하기 위해 식민지로 진입하고, 키라가 그들을 돕기 위해 도착한다.
- 45화 · 키라와 무가 라우를 마주치고, 디어카와 야즈크가 자신들의 사명을 되묻는 가운데 세력들이 충돌하다
- 46화 · 플레이는 뉴트론 제머 데이터를 가지고 라우를 탈출하고 키라는 프리덤에 큰 피해를 주면서 그녀를 구한다.
- 47화 · 지구 연방이 PLANTs에 핵무기를 공격하고 Freedom과 Justice가 탄두를 요격한다.
- 48화 · GENESIS의 레이저가 지구 연방군을 강타하고 승무원들이 무사하기를 기도하다
- 49화 · 지구 연방군 실패, 뮤가 아크엔젤을 구하기 위해 자신을 희생하다