47화: 지구 연방이 PLANTs에 핵무기를 공격하고 Freedom과 Justice가 탄두를 요격한다.
2003년 9월 6일 방영
뉴트론 재머 캔슬러를 활용하여 지구 연방군은 PLANTs에 대한 전면적인 공세를 개시한다. 보아즈 군사 소행성이 핵 타격으로 파괴되며 PLANTs에 대한 공세의 서막이 열린다. 프리덤과 저스티스 모빌슈트가 전투 지역에 도착하여 들어오는 모든 핵 탄두를 무력화한다. 이 개입에 대응하여 패트릭 자라는 GENESIS 무기 시스템의 출동을 명령한다.
에피소드 수
- 43화 · 멘델 식민지에서의 쓰리십스 얼라이언스 은신, ZAFT와 지구 연방군 추격
- 44화 · 무와 디어카가 라우를 마주하기 위해 식민지로 진입하고, 키라가 그들을 돕기 위해 도착한다.
- 45화 · 키라와 무가 라우를 마주치고, 디어카와 야즈크가 자신들의 사명을 되묻는 가운데 세력들이 충돌하다
- 46화 · 플레이는 뉴트론 제머 데이터를 가지고 라우를 탈출하고 키라는 프리덤에 큰 피해를 주면서 그녀를 구한다.
- 47화 · 지구 연방이 PLANTs에 핵무기를 공격하고 Freedom과 Justice가 탄두를 요격한다.
- 48화 · GENESIS의 레이저가 지구 연방군을 강타하고 승무원들이 무사하기를 기도하다
- 49화 · 지구 연방군 실패, 뮤가 아크엔젤을 구하기 위해 자신을 희생하다
- 50화 · 대량 파괴 무기 사용 방지를 위한 대천사와 이터널의 전투