Koukaku Kidoutai: Shin Gekijouban

미래 일본에서 전 세계적인 대규모 전쟁 이후 기술의 발전으로 사이버네틱스가 널리 사용되며 사람들은 생명을 연장하고 고통을 덜 수 있게 되었다. 모든 개인은 의식과 정체성을 연결하는 네트워크인 '고스트'에 연결되어 있다. 사회에 위협이 되는 것은 신체와 기억을 장악할 수 있는 사이버 테러리스트들이다. 시스템을 통해 퍼지는 바이러스 '파이어-스타터'는 일본 총리의 암살로 이어진다. 메이저 모토코 쿠사나기와 그녀의 전문 팀은 이 바이러스의 기원을 밝혀내는 임무를 맡게 되고, 조사가 진행되면서 정부의 부정 행위의 흔적을 발견하고, 익숙한 외모를 지닌 신비한 브로커와 마주친다.