Koukaku Kidoutai: Stand Alone Complex

단서 하나로 제9과는 허난 출신 범죄 조직이 금융 기관을 공격하려 한다는 사실을 파악하고 수사에 나선다. 팀은 조직의 숨은 기지를 침투해 즉각적인 위협을 제거하지만, 작전의 결과에 대한 의문이 제기되면서 쿠사나기 대위와 제9과는 조직이 숨겨둔 더 큰 목적을 실행하지 못하도록 추가 조사에 돌입한다.