Malicious Code

Hiiro trafia do Tokio, po tym jak jego autobus zostaje zaatakowany, miasta, które miało zostać zamknięte. Tam spotyka innych z „czerwonym okiem”, osoby zidentyfikowane jako nośniki wirusa Pandory. Choć traktują się wzajemnie jak sojusznicy, napotykają ataki z wielu stron. Przyczyną tych ataków jest coś, co wiąże Hiiro i jego towarzyszy, a konkretnie ich strukturę genetyczną.