Digimon Chronicle

Bu hikâye, 2004 yılı Digimon ürün hattının bir parçasıydı ve başta V-Tamer 01'i yerine geçecek yeni bir manga olacakmış gibi düşünülmüştü. Sonunda ise "Pendulum X" dijital bebeklerle birlikte verilen broşürlerde yer alan bir öykü hâline geldi. Her broşürde ayrıca altı sayfalık bir manga da yer alıyordu ve dört bölüm farklı Pendulum X versiyonlarıyla birlikte yayımlandı. Hikâyede, sayıları giderek artan Digimon'ların Yggdrasil isimli bilgisayar tarafından yönetildiği Dijital Dünyadan bahsediliyor. Yggdrasil, artan Digimon nüfusundan dolayı Dijital Tehlike'yi başlatmış ve ardından Urd, Versandi ve Skuld isimli üç katmandan oluşan yeni bir Dijital Dünyası yaratmıştır. Yargılamak istediği istenmeyen Digimon'ları yok etmek için Proje Ark ve X Programı'na başlamıştır. Buna karşılık bazı Digimon, X-Antikoru geliştirmişlerdir. Bu antikor onları güçlendirmekte ve X Programı'na karşı dirençli hâle getirmektedir. Yggdrasil, düzeni sağlamak amacıyla Kral Kavalerleri görevlendirmiştir. Kouta, Yuuji ve Shinji isimli üç insan, Dijital Dünyaya girmiş ve ortak Digimon'larını bulmuştur. Kouta ve Yuuji, Yggdrasil ve Kral Kavalerleri'ne karşı dururken, Shinji ise Yggdrasil'in yanında yer almıştır.