Fate/Apocrypha

Fuyuki'den önceki bir savaştan sonra alınan Büyük Grail'ın yıllarca kayıplarda kaldığı başka bir hikâyenin paralel dünyası vardır. 2000'lerde, Grail'i çalan Yggdmillennia grubu, Sihirbazlar Birliği'nden ayrılıp eser üzerindeki sahipliğini ilan eder. Birliği, onu geri almak için elli sihirbaz gönderir ama neredeyse hepsi karşı taraftan gelen bir Lancer tarafından öldürülür. Bir hayatta kalan, Grail'in yedek sistemi olan bir sistem aktif eder ve on dört Servant'ın çağrılmasını sağlar. Bu, Trifas'ta büyük ölçekli bir Kutsal Grail Savaşı başlatır. Savaş iki kola ayrılır: Yggdmillennia üyelerinden oluşan Siyah Kol ve çoğunlukla Sihirbazlar Birliği'nden, bir de Kiliseden temsilci bulunan Kırmızı Kol. Grail ayrıca çatışmayı denetlemek için bir Ruler çağırır.