Tập 31: Đội Archangel thương tiếc Kira và Tolle trong khi Cagalli đối mặt với Athrun
Phát sóng ngày 10 tháng 5, 2003
Đội Archangel thương tiếc cái chết của Kira và Tolle. Cagalli tìm kiếm Kira trong đống đổ nát nhưng lại gặp Athrun và chất vấn anh về việc giết Kira. Kira tỉnh dậy và nhận được sự chăm sóc của Lacus.
Số tập
- Tập 27 · Erica Simmons phân tích nhật ký chiến đấu của Kira và đề xuất giả thuyết yếu tố SEED trong khi yêu cầu hệ điều hành mới cho Orb.
- Tập 28 · Kira gặp bố mẹ tại Orb, hoàn tất hệ điều hành Astrays và gặp Athrun.
- Tập 29 · Archangel rời Orb hướng về Alaska trong khi Zala Team giao chiến
- Tập 30 · Đội Zala tấn công trong khi Dearka đầu hàng và Tolle tử trận, khơi mào cuộc đấu sinh tử giữa Kira và Athrun.
- Tập 31 · Đội Archangel thương tiếc Kira và Tolle trong khi Cagalli đối mặt với Athrun
- Tập 32 · Miriallia tấn công Dearka trên Archangel trước khi cứu anh khỏi đạn của Flay
- Tập 33 · Phi hành đoàn Archangel đối mặt với cuộc thẩm vấn về việc thoát khỏi Heliopolis và giao nộp Strike cho Kira Yamato.
- Tập 34 · Flay, Mu và Natarle đối mặt với lệnh chuyển giao trong khi Lacus giao phó Freedom cho Kira
- Tập 35 · ZAFT và Liên minh Trái Đất đối đầu trong Chiến dịch Spitbreak khi Kira đến giải cứu Archangel khỏi sự hủy diệt.