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Un grupo terrorista ha declarado la independencia en el Polo Sur y ha desplegado potentes bombas de nitrógeno a lo largo de varias costas, incluyendo tres cerca de Japón, programadas para detonar en diez días. Las bombas no pudieron ser desactivadas con éxito por Estados Unidos, dejando a Japón con la responsabilidad de desactivarlas. El equipo de desactivación de bombas cuenta con Machida Machiko, una joven prodigio, supervisada por Aranagi Nagito, un aprendiz en desactivación de explosivos. Machiko ha acordado con Nagito y el jefe del programa de desactivación neutralizar las bombas y eliminar la amenaza. Sin embargo, tras complicaciones durante su primera misión, solo podrían confiar en un programa de desactivación creado por Machiko. El equipo debe decidir si pueden usar esta herramienta para evitar que las bombas exploten y detener los planes de los terroristas.