Saber Marionette J

Sa malayong hinaharap, ang lubhang pagdami ng populasyon sa Earth ay nag-uudyok ng pagsisikap na manirahan sa ibang planeta. Bumagsak ang barkong tinatawag na Mesopotamia, na ikinamatay ng lahat maliban sa anim na tao, na tumakas sa isang planetang tinatawag na Terra ll, katulad ng Earth. Lahat ng nakaligtas ay lalaki, kaya nagtatag sila ng anim na bansa at gumamit ng cloning at genetic engineering upang magparami. Dahil walang mga babae, gumawa sila ng mga android na walang damdamin na tinawag na Marionettes upang gawin ang pang-araw-araw na gawain. Isang batang lalaki na nagngangalang Otaru ang nakatuklas at nagpagana ng tatlong natatanging battle-type Marionettes na may damdamin dahil sa isang Maiden Circuit. Tinutulungan niya silang paunlarin ang kanilang nararamdaman. Nang ang isang katabing bansa ay naghangad mangibabaw sa mundo, dapat ipagtanggol ni Otaru at ng kaniyang mga Marionettes ang kanilang bansa.