एपि. 1: Ukiya Shun अपने घर को आक्रामकों से बचाने के लिए एक द्वार खोलता है

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मई 1969 में, जापान समृद्धि का अनुभव कर रहा है जबकि वैश्विक स्तर पर असामान्य आपदाएं बढ़ रही हैं। गुप्त संगठन A.E.G.I.S. इन घटनाओं को Invaders नामक इकाइयों तक पहुंचाता है। आगे की तबाही को रोकने के लिए, Far Eastern branch Gate Keepers की तलाश करता है, जो द्वार खोलने में सक्षम व्यक्ति होते हैं। कहानी Ukiya Shun को पेश करती है, एक किशोर जो अपनी माँ और छोटी बहन Saemi के साथ रहता है। उसकी ज़िंदगी तब बदल जाती है जब उसका घर Invaders और Ruriko Ikusawa, Far Eastern Branch की पहली भर्ती के बीच की लड़ाई में फंस जाता है। अपने परिवार के लिए खतरे के कारण गुस्से में, Ukiya बिना जानते हुए एक द्वार खोल देता है। वह फिर इस शक्ति का उपयोग करके Invader खतरे को अकेले ही हरा देता है, जो वैश्विक रक्षा प्रयास में उसकी शामिल होने की शुरुआत का मार्क है।