1화: 우키야 슈운, 침략자들로부터 고향을 지키기 위해 게이트를 열다

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1969년 5월, 일본은 번영을 누리는 반면 전 세계적으로 비자연적인 재앙이 증가하고 있다. 비밀 조직 A.E.G.I.S.는 이러한 사건들을 Invaders라는 존재들과 연결 지으며, 추가 파괴를 막기 위해 게이트를 열 수 있는 Gate Keepers를 찾고 있다. 이 이야기는 어머니와 여동생 Saemi와 함께 사는 청소년 우키야 슈운을 소개한다. 그의 삶은 고향이 첫 Far Eastern Branch 입성자 Ruriko Ikusawa와 Invaders 간의 전투에 휘말리며 변한다. 가족에 대한 위협에 분노한 우키야는 모르게도 게이트를 열게 되고, 이 힘을 이용해 Invaders의 위협을 혼자서 물리친다. 이는 그가 글로벌 방어 노력에 관여하기 시작하는 시발점이 된다.