Koukaku Kidoutai: Stand Alone Complex

2032 तक, मानव और मशीनों के बीच की सीमा धुंधली हो चुकी है। चीफ Aramaki और उनके साइबॉग अधिकारी Motoko Kusanagi द्वारा संचालित विशेष काउंटर-टेररिस्ट यूनिट सेक्शन 9, साइबॉग से जुड़े अपराधों की जांच करता है। टीम 'द अवेकनेड' नामक एक खतरनाक समूह से टकराती है, जिस पर शक है कि वह शिकारियों की जानकारी के बिना ही राज्य के अपराधों को अंजाम देने के लिए लोगों के दिमाग और शरीर को हैक कर लेता है। इनमें से एक व्यक्ति को गिरफ्तार करने के बाद, Kusanagi समूह के नेता की पहचान जानने के लिए उसके साइबरब्रेन तक पहुंचती है। उसे मिली जानकारी उसे साइबरस्पेस की गहरी खोज में ले जाती है, जो एक ऐसा अनुभव है जो उसे गहराई से प्रभावित करता है।