Ep. 48: Armstrong menyatakan pemberontakan sementara Ensy menculik Alphonse dan para Elric menghadapi ancaman baru di Central.

Di perbatasan utara dengan Drachma, Armstrong dan Mustang mengumumkan pemberontakan mereka terhadap Führer. Saat Sloth menguap di depan mata para Elric dan Wrath, Ensy menyamar sebagai Winry untuk menculik Alphonse. Edward mengejarnya tetapi diserang oleh Wrath karena telah membunuh Sloth. Izumi mengalihkan perhatian Wrath, memungkinkan Edward dan Izumi berangkat menuju Central untuk menghadapi homunculus lainnya. Sementara itu, saudara-saudara Tringham tiba di Central dengan pesan untuk para Elric. Russell menyamar sebagai Edward di sebuah toko buku untuk menghindari pembayaran, yang menyebabkan kedua saudara tersebut disangka sebagai Elric asli dan dijatuhi hukuman mati oleh Führer. Mereka diselamatkan oleh Brosh dan Ross. Kelompok tersebut bertemu dengan Edward dan Izumi, yang dihalangi oleh Archer, yang kini menjadi cyborg. Izumi tetap tinggal untuk melawan Archer, memerintahkan yang lain untuk melarikan diri. Edward menghentikan sebuah mobil yang ditumpangi Mustang dan Hawkeye, yang telah bersembunyi di Central untuk menyerang Führer. Selama perjalanan, Edward dan Mustang mendamaikan persahabatan mereka sebelum berpisah.
Episode
- Ep. 44 · Hohenheim of Light
- Ep. 45 · Hohenheim menghadapi Dante, pemimpin homunculus, saat masa lalu bersama mereka terungkap
- Ep. 46 · Tucker menukar Alphonse untuk kebangkitan Nina sementara Lust mencari kemanusiaan dari Edward
- Ep. 47 · Edward dan sekutunya menghadapi homunculus di pabrik untuk menghadapi ciptaan mereka
- Ep. 48 · Armstrong menyatakan pemberontakan sementara Ensy menculik Alphonse dan para Elric menghadapi ancaman baru di Central.
- Ep. 49 · Iri hati membawa Alphonse kepada pemimpin homunculus sementara Edward menemukan kota tersembunyi di bawah Central.
- Ep. 50 · Edward dan Hohenheim melarikan diri dari London era Perang Dunia I sementara Dante memanipulasi homunculus untuk mencuri tubuh.
- Ep. 51 · Alphonse mengorbankan dirinya untuk menyelamatkan Edward sementara Mustang membunuh Führer dan Dante menemui ajalnya.