48화: 아머스트롱이 반역을 선언하고 엔비가 알폰소를 납치하며 엘릭 형제는 센트랄에서 새로운 위협에 직면한다
2004년 9월 11일 방영필러

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드라크마와의 북부 국경에서 아머스트롱과 마스타نگ은 후러어에 대한 반역을 선언한다. 슬로스가 엘릭 형제와 래쓰 앞에서 증발하는 동안, 엔비는 윈리로 변장해 알폰소를 납치한다. 에드워드가 추격하지만 슬로스를 죽였다는 이유로 래쓰의 공격을 받는다. 이즈미가 래쓰를 distraction시켜 에드워드와 이즈미가 다른 호문쿨루스와 대결하기 위해 센트랄로 떠날 수 있게 한다. 한편, 트링엄 형제가 엘릭 형제에게 전할 메시지와 함께 센트랄에 도착한다. 러셀은 서점에서 에드워드로 가장해 요금을 면하려다 형제 모두 진짜 엘릭 형제로 오인받아 후러어에게 사형을 선고받는다. 브로시와 로스가 그들을 구해준다. 일행은 에드워드와 이즈미를 만나지만, 사이보그가 된 아처에게 저지당한다. 이즈미는 아처와 싸우기로 하고 나머지는 도망가라고 명령한다. 에드워드는 마스타نگ과 호크아이의 차를 세우고, 이들은 후러어를 공격하기 위해 센트랄에 숨어 있었다. 차 안에서는 에드워드와 마스타نگ이 우정을 회복한 뒤 헤어진다.
에피소드 수
- 44화 · 빛의 호엔하임
- 45화 · 호엔하임이 호문클루스 지도자 단테와 맞서며 공통된 과거가 드러나다
- 46화 · 터커가 알폰스와 니나 부활을 위한 거래를 하고, 러스트가 에드워드에게 인간이 되기를 요구하다
- 47화 · 에드워드와 동맹들이 공장에서 호문쿨루스를 대면하며 그들의 창조물을 마주하다
- 48화 · 아머스트롱이 반역을 선언하고 엔비가 알폰소를 납치하며 엘릭 형제는 센트랄에서 새로운 위협에 직면한다
- 49화 · 질투가 알폰스를 호문클루스 지도자에게 데려가고 에드워드는 센트럴 아래 숨겨진 도시를 발견한다.
- 50화 · 에드워드와 호엔하임은 제1차 세계 대전 런던을 탈출하고, 단테는 호문쿨루스의 몸을 훔치기 위해 조작한다.
- 51화 · 에드워드를 구하기 위해 알폰스가 자신을 희생하고, 마스타ング가 후러를 처단하며, 단테가 최후를 맞는다.