Ep. 89: Hikari e Satoshi entrano in un universo alternativo per indagare sulla devoluzione dei Pokémon e sulle misteriose sparizioni.

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Dopo che il Pochama di Hikari viene rapito da una controparte di un universo alternativo, il gruppo si reca a Sinnoh. Rocket Dan, proveniente da un'altra dimensione, cattura Lucario e Intereon, spingendo Go e Hikari a seguirlo in quel mondo. Lì, l'Hikari alternativa rivela che i Pokémon si stanno evolvendo all'indietro fino a diventare uova. Nel frattempo, Satoshi e Koharu sospettano il coinvolgimento di Palkia e visitano una biblioteca per informarsi su Dialga, Palkia e Arceus grazie a Shirona. Dopo che l'Rocket Dan alternativo attacca e poi si ritira, Satoshi e Koharu entrano nell'altro universo proprio prima che il portale si chiuda. Mentre Go e i Hikari studiano il tempo e lo spazio, Satoshi incontra una versione alternativa di se stesso.