Ep. 1: Ayato e Reika viaggiano verso il Santuario di Xephon sotto la Baia di Tokyo dopo un incidente ferroviario.

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Ayato Kamina, Hiroko Asahina e Mamoru Torigai viaggiano in treno per un test di chimica mentre sono seguiti da una donna misteriosa. Un terremoto provoca l'incidente del treno, ferendo Hiroko e Mamoru. Ayato cerca aiuto ma scopre che Tokyo è sotto attacco da parte di aerei futuristici. Un enorme Dolem di nome Allegretto viene schierato per difendere la capitale. Tra le macerie, Ayato incontra Reika Mishima, il cui aspetto evoca nostalgia. Gli agenti federali tentano di arrestare Ayato nella metropolitana, ma la donna misteriosa lo salva. Ayato rifiuta la sua offerta e sale su un treno con Reika per raggiungere la stazione speciale nota come "Il Santuario di Xephon" sotto la Baia di Tokyo. All'interno, trovano un'area di colore azzurro cielo con un uovo gigante nell'acqua. I Dolem cantano sopra, influenzando Ayato, ma Reika controbatte con la propria canzone. L'uovo si crepa, rivelando ali all'interno.