Kagaku Ninja-Tai Gatchaman F

リーダーXの残存断片はZに進化し、カウント・エゴボスラーとその部下たちとともに、地球とサイエンス忍者隊を破壊しようとする。アンドリュースの死後、ナンブ博士がISOの責任者となり、チームは水の中のガラタウン基地に移動する。エンジニア・カモがチームに加わり、ニューゴッドフェニックスが破壊された後、新たなメカであるガチャスパルタンを手に入れる。ガチャスパルタンには、ケンがガチャフェンサー剣を使ってのみ使用できる特殊モード「ハイパーシュート」が搭載されており、このモードの長時間使用はケンに放射線障害を引き起こし、彼の命を少しずつ奪っていく。Zは「ポイズンアップル」と名付けられた反物質の小惑星を使って地球を破壊する計画を進めている。