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13年前、天使による侵略が始まった。これに応じて、地球を守るための複数の組織が設立された。その一つが、日本で最も強力とされる高校・聖華学園の「天使暗殺班」である。この学校に在籍する生徒たちは、いずれも有影響力のある富裕層の家庭から来ており、国家のエリート層を代表している。無鉄砲で洗練されていない田舎の生徒・上杉健太郎と、寡黙で謎めいたその仲間・星星野新星が、この組織への招待を受けた時、その結果はまだ誰にも分からない。