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十三年前，天使入侵開始，為此成立了多個組織以保護地球。其中一個組織是位於聖家學園的天使暗殺小隊，被視為日本最頂尖的單位。該校學生皆來自有影響力且富裕的家庭，代表國家的菁英階層。當來自鄉村、性格魯莽粗魯的學生上杉賢勝，以及他沉默謎一般的同伴星合新未來收到入會邀請時，後果將無人能知。