46화: 터커가 알폰스와 니나 부활을 위한 거래를 하고, 러스트가 에드워드에게 인간이 되기를 요구하다
2004년 8월 28일 방영필러

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터커는 알폰스와 협상을 벌이며 철학자의 돌을 활용하는 방법을 가르쳐 주겠다고 제안한다. 그 대가로 알폰스는 돌을 사용해 터커의 딸 니나를 부활시키기로 동의한다. 동시에 러스트는 에드워드에게 자신의 제안을 건넨다. 그녀는 인간이 되어 주는 조건으로 에드워드의 도움을 제공하겠다고 제안한다. 이러한 병행되는 교환은 알케미 아티팩트의 사용과 존재의 본성에 관한 중대한 개인적 희생과 도덕적 타협을 수반하며, 각기 다른 목표를 달성하기 위해 다양한 캐릭터들이 취하는 절박한 조치들을 강조한다.
에피소드 수
- 42화 · 스칼의 군대에 대한 최후의 행동 후 알폰스가 리오르 시를 변형하다
- 43화 · 호엔하임이 윈리와 만나고, 마스타드가 엘릭 형제를 레셈불로 쫓는다.
- 44화 · 빛의 호엔하임
- 45화 · 호엔하임이 호문클루스 지도자 단테와 맞서며 공통된 과거가 드러나다
- 46화 · 터커가 알폰스와 니나 부활을 위한 거래를 하고, 러스트가 에드워드에게 인간이 되기를 요구하다
- 47화 · 에드워드와 동맹들이 공장에서 호문쿨루스를 대면하며 그들의 창조물을 마주하다
- 48화 · 아머스트롱이 반역을 선언하고 엔비가 알폰소를 납치하며 엘릭 형제는 센트랄에서 새로운 위협에 직면한다
- 49화 · 질투가 알폰스를 호문클루스 지도자에게 데려가고 에드워드는 센트럴 아래 숨겨진 도시를 발견한다.
- 50화 · 에드워드와 호엔하임은 제1차 세계 대전 런던을 탈출하고, 단테는 호문쿨루스의 몸을 훔치기 위해 조작한다.