Pocket Monsters Advanced Generation: Pokémon Ranger to Umi no Ouji Manaphy

여행자들이 한적한 사막 지대에 고립되자, 해적단 마리너 트roupe의 연극사가 나타나 물의 신전 아쿠샤와 숨겨진 보물인 물의 왕관에 대한 전설을 들려준다. 물 속성 포켓몬인 '바다의 왕자' 마나피의 알을 신전에 전달해야 하는 임무를 수행 중인 레인저 재키와 함께 모험에 나선 그들은, 세계 지배를 꿈꾸는 해적 파antom이 물의 왕관을 차지하려는 야욕을 가진 것을 알게 된다. 파antom은 거대한 잠수함과 첨단 기술을 동원해 공격을 가하고, 로켓단도 이 일에 개입한다. 재키는 포켓몬의 힘을 잠시나마 빌려 쓸 수 있는 캡처 스타일러를 사용해 그들을 막아내며 전투를 펼친다. 전투 도중 알은 깨어나 마나피가 모습을 드러내고, 이제 그들은 물의 왕관의 비밀을 밝히고 마나피를 보호하며 물의 신전 아쿠샤로 향하는 여정을 시작한다.