Ao no 6-gou

가까운 미래, 해수면 상승으로 인해 지구의 해안 지역 대부분이 잠기게 된다. 이 침수 사태의 책임은 과학자인 조른다이크에게 있으며, 그는 지열 에너지를 이용해 남극에서 극도 반전을 유발함으로써 전쟁의 결과를 영구히 바꾸려 한다. 그의 혼합 생명체 군단은 이미 대량의 인명 피해와 인간 도시들의 파괴를 초래했고, 생존자들은 이 위협에 맞서 살아남기 위해 싸우고 있다. 이 투쟁의 핵심 선박 중 하나는 블루 서브마린 #6이다.