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Em 2008, Takumi Nishijou, um estudante da Suimei Academy em Shibuya, se envolve em acontecimentos inusitados batizados de "eventos da Nova Geração". Em 7 de setembro, cinco estudantes morrem ao se jogar de um prédio alto, e em 19 de setembro, um homem é encontrado morto com um feto incrustado em seu abdômen. Em 28 de setembro, Takumi discute esses incidentes com um conhecido online chamado Grim, que o informa enquanto evita consumir notícias. Um usuário chamado Shōgun entra no bate-papo, mas permanece em silêncio até Grim sair, momento em que envia a Takumi imagens perturbadoras de uma morte violenta. No dia seguinte, Takumi se depara com a mesma cena ao voltar para casa de uma lan house. Ele foge do local em pânico após encontrar uma garota ensangüentada de cabelos rosas usando o uniforme da Suimei Academy. À medida que os acontecimentos avançam, Takumi tenta manter distância de Shōgun e dos eventos da Nova Geração, embora cada vez mais seja puxado para dentro de um mistério maior que se desenrola.